Profesör: Mikrobiyom pazarlaması bilimsel kanıtların çok önünde

San Diego'daki Kaliforniya Üniversitesi'nde pediatri, biyomühendislik ve bilgisayar bilimleri profesörü olan Rob Knight, probiyotikler ve diğer mikrobiyal uygulamaların pazarlanmasının, bilim dünyasının kanıtladıklarından çok daha önde olduğunu söylüyor. Knight'a göre uzun vadede mikroorganizmalar hem sağlık hem de çevre alanında önemli faydalar sağlayabilir.

Probiyotik pazarlaması kanıtların önünde

Knight, probiyotiklerle ilgili pazarlamanın her zaman gerçek kanıtlardan çok daha ileride olduğunu ve bu durumun yıllar içinde düzelmediğini belirtiyor. Antibiyotik sonrası ishal ve bazı irritabl bağırsak sendromu türleri gibi durumlarda probiyotiklerin gerçekten yardımcı olduğuna dair kanıtlar bulunduğunu, ancak çoğu insanın probiyotikleri sanki küçük bir molekül ilaçmış gibi kullandığını ifade ediyor. Knight, bu durumu, birinin kendini kötü hissettiğinde eczaneden tüm ilaçları alıp hepsini birden içmesine benzetiyor.

Knight, biyoterapötik ürünlerde çok daha fazla mikroorganizma çeşidi olduğunu ve bazılarının belirli insan gruplarına zarar verebileceğini vurguluyor. Şirketlerin, kanıt gerektirmeyen gıda takviyeleri yerine sıkı klinik çalışmalar gerektiren ilaçlara yönelmesiyle pazarın temizleneceğini ve daha büyük etkili ürünlerin ortaya çıkacağını umuyor.

Bilimde standardizasyon eksikliği

Bilim dünyasında standardizasyonun yeterince takdir edilmediğini söyleyen Knight, araştırmacılar arasındaki farklı analiz yöntemlerinin sonuçları etkilediğini belirtiyor. İnflamatuar bağırsak hastalığı (IBD) gibi bazı hastalıklarda sinyalin çok güçlü ve tekrarlanabilir olduğunu, ancak obezite gibi durumlarda sinyalin daha zayıf olduğunu ve bir popülasyondan diğerine aktarılamadığını ifade ediyor. Knight, bunun metodolojik farklılıklardan değil, popülasyondaki etnik ve coğrafi çeşitliliğin eksikliğinden kaynaklandığını düşünüyor.

Genomik ve mikrobiyom çalışmalarında, eğitim verisi dışındaki bireylerde geçerli olacak modeller geliştirmenin önemli olduğunu vurgulayan Knight, Estonya gen bankası gibi ulusal girişimlerin bu tür modellerin yerel popülasyonlara uyarlanmasında kritik rol oynadığını söylüyor.

Araştırma güvenilirliği ve geri çekilen çalışmalar

Knight, 2024 yılında Nature dergisinde geri çekilen ve kendisinin de yazar olduğu kanser mikrobiyomu çalışmasına da değiniyor. Çalışmanın, farklı kanser türlerini mikrobiyal sinyallerden ayırt edebilen bir model sunduğunu, ancak eleştirmenlerin modelin hangi mikroorganizmalara dayandığını tam olarak söyleyememesini eleştirdiğini aktarıyor. Knight, bu durumu bir görüntü sınıflandırıcının kedileri köpeklerden ayırt edebilmesi için her pikselde hangisinin kedi ya da köpek olduğunu açıklamasının zorluğuna benzetiyor.

Eleştirmenlerin daha sonra kendi düşük duyarlılıklı yöntemleriyle bazı kanser türlerinde mikroorganizma bulunduğunu gösterdiğini belirten Knight, bilimsel sürecin kendini düzeltebildiğini, ancak hakem değerlendirmesinin bu süreçte önemli olduğunu ve başka bir sistemin daha iyi olmadığını ifade ediyor.

Knight, araştırmacıların veri işleme adımlarını takip etmelerini sağlayan QIIME2 platformunu kullanmanın, sonuçların tekrarlanabilirliği açısından önemli olduğunu, ancak bu tür araçların bilimsel yayıncılıkta devrim yaratmasının zaman alabileceğini belirtiyor.